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UE 2LM09 Microbiologie médicale

En pratique

  • Cette unité d'enseignement (UE) articule 3 activités d'apprentissage :
    • 2L090 Microbiologie médicale
    • 2L091 Laboratoire de microbiologie médicale
    • 2L092 AIP stage préparatoire en microbiologie
  • En 2023-2024, elle s'organise au premier quadrimestre et deuxième quadrimestre et couvre 8 crédits (ECTS).
  • L'enseignement est principalement centralisé dans le campus : Sainte-Julienne
  • Attention, cette UE n'est pas remédiable d'une session à l'autre
  • Modalités d'enseignement
    • Auditoire
    • Groupe classe
    • Sous-groupe
    • Travaux pratiques dans un local équipé spécifiquement

Activité d’apprentissage

Les finalités de l'UE

Acquérir les bases théoriques nécessaires à :

  • La compréhension du fonctionnement du système immunitaire ainsi que sa façon de réagir face à des microorganismes ;
  • L'étude de la classification, des caractéristiques et des méthodes de diagnostic en laboratoire des bactéries rencontrées dans un laboratoire de biologie médicale ;
  • L'étude de l’origine des infections en milieu hospitalier, des méthodes de lutte contre celles-ci ;
  • La compréhension des mécanismes d'action des antibiotiques ainsi que des résistances bactériennes qui y sont associées.

Les contenus de l'UE

Les activités d’apprentissage « Microbiologie médicale », « Laboratoire de microbiologie médicale » et « AIP Stage préparatoire en microbiologie » permettent d’asseoir les bases théoriques de l'immunité et du diagnostic des infections relatives aux micro-organismes pathogènes pour l’homme.

Contenu pour « Microbiologie médicale » :

  • Immunité générale et réactions immunitaires liées aux infections bactériennes ;
  • Nomenclature des familles, genres et espèces bactériennes les plus rencontrées en milieu hospitalier et présentant un intérêt clinique ;
  • Etudes des grandes familles d’antibiotiques et de leurs modes d’action.

Contenu pour « Laboratoire de microbiologie médicale » :

  • Composition et choix des milieux de culture ;
  • Techniques du suivi de la croissance bactérienne (prélèvement, ensemencement, isolement, étude qualitative et étude quantitative) ;
  • Etude des caractères morphologiques, biochimiques et de culture des bactéries pathogènes et commensales ;
  • Utilisation des galeries d’identification biochimique ;
  • Principe des tests sérologiques ;
  • Recherche de la sensibilité bactérienne aux antibiotiques ;
  • Analyse bactériologique de l’eau, de la viande et de l’urine.

Contenu pour « AIP Stages préparatoires en microbiologie » :

  • Etude des différentes techniques de désinfection et de stérilisation du matériel de laboratoire ;
  • Etude des différentes techniques d’ensemencement ;
  • Etude des différentes techniques de dénombrement ;
  • Etude des analyses bactériologiques (dénombrement, identification et antibiogramme) de prélèvements de gorge, de sang, urétraux et de selles.

Les acquis d'apprentissage visés par l'UE

Au terme de cette UE et de manière autonome, l’étudiant :

  • Décrit les différentes étapes du processus immunologique;
  • Décrit les différents mécanismes de l’immunité innée et adaptative ;
  • Cite et décrit les organes, tissus, cellules et molécules intervenant dans le système immunitaire ;
  • Décrit les différentes processus immunologiques activés lors d'une infection microbiologique ;
  • Nomme les familles, genres et espèces bactériennes les plus rencontrées en milieu hospitalier et présentant un intérêt clinique ;
  • Décrit les grandes familles d’antibiotiques et leurs modes d’action ;
  • Sélectionne et réalise les milieux de culture adaptés aux bactéries analysées ;
  • Réalise et analyse les prélèvements, les ensemencements et les isolements bactériens ;
  • Exécute une analyse qualitative et quantitative de la croissance bactérienne sur milieu solide et liquide ;
  • Décrit les caractères morphologiques, biochimiques et de culture des bactéries pathogènes et commensales ;
  • Utilise les galeries d’identification biochimique des bactéries ;
  • Réalise des tests sérologiques ;
  • Examine la sensibilité bactérienne aux antibiotiques (méthode par disque, E-test, galeries) ;
  • Vérifie la qualité bactériologique d’un échantillon de viande en référence aux normes en vigueur ;
  • Décrit les différentes techniques courantes en laboratoire de microbiologie (stérilisation, désinfection, ensemencement de milieux de culture, dénombrement bactérien) ;
  • Décrit les différentes analyses bactériologiques à partir de fluides humains (urine, gorge, expectoration, LCR, selles et prélèvement urétral et vaginal).

Les méthodes d'enseignement-apprentissage

Méthodes d’enseignement pour « Microbiologie médicale » :

  • Cours théorique illustré par de nombreux exemples.

Méthodes d’enseignement pour « Laboratoire de microbiologie médicale » :

  • Application pratique des notions théoriques de microbiologie via des expériences, analyse des résultats et rédaction de rapports en travail individuel et par groupe.

Méthodes d’enseignement pour « AIP Stage préparatoire en microbiologie » :

  • Cours théorique illustré par des exemples et du matériel de laboratoire ainsi que par une visite détaillée du laboratoire scolaire. 

Engagement attendu de la part de l'étudiant.e

Dans cette UE, une participation assidue aux cours est vivement recommandée car la complexité des exemples et de la théorie augmente.  Les étudiant.es seront encouragé.es à poser des questions chaque fois que cela est nécessaire. Nous conseillons aux étudiant.es d’oser mobiliser cette possibilité de questionnement. 

De plus, les concepts abordés dans cette UE sont complexes et demandent de créer des liens entre les différentes parties d'une même activité d'apprentissage et entre les différentes activités d'apprentissage de l'UE.

La participation active aux séances de laboratoire, en possession de son matériel, est indispensable.

Il est vivement conseillé de préparer chaque séance de laboratoire en prenant connaissance des manipulations qui seront effectuées et en réalisant des liens avec les notions théoriques déjà vues aux cours.

Examen de microbiologie médicale

Cette épreuve présente des modalités similaires pour toutes les sessions. Elle est organisée durant la session. Il s'agit d'une épreuve intégrée. Cette épreuve est individuelle. Concrètement, l'épreuve repose sur une formulation écrite. L'épreuve repose sur des réponses courtes, réponses choisies parmi des propositions, formulations personnelles. Elle se déroule à cours fermé. La correction de cette épreuve est assurée par délibération d'une équipe d’enseignant.es.

Rapports de laboratoire de microbiologie médicale

Cette épreuve présente des modalités spécifiques à la 1re session. Elle est organisée de manière continue. Il s'agit d'un travail. Cette épreuve est individuelle et en équipe. Concrètement, l'épreuve repose sur une formulation écrite. L'épreuve repose sur des formulations personnelles. Elle se déroule à cours ouvert. La correction de cette épreuve est assurée par validation d'un.e enseignant.e.

Interrogation AIP Stage préparatoire en microbiologie

Cette épreuve présente des modalités spécifiques à la 1re session. Elle est organisée avant la session. Il s'agit d'un examen. Cette épreuve est individuelle. Concrètement, l'épreuve repose sur une formulation écrite. L'épreuve repose sur des réponses courtes, réponses choisies parmi des propositions, formulations personnelles. Elle se déroule à cours fermé. La correction de cette épreuve est assurée par validation d'un.e enseignant.e.

Examen AIP Stage préparatoire en microbiologie

Cette épreuve présente des modalités spécifiques à la seconde session. Elle est organisée durant la session. Il s'agit d'un examen. Cette épreuve est individuelle. Concrètement, l'épreuve repose sur une formulation écrite. L'épreuve repose sur des réponses courtes, réponses choisies parmi des propositions, formulations personnelles. Elle se déroule à cours fermé. La correction de cette épreuve est assurée par validation d'un.e enseignant.e.

Règles de l’UE

Quels sont les supports et matériels de cours indispensables ?

Supports et matériels de cours

 

 

Comment la note globale de l’UE est-elle déterminée ?

Explication de la pondération des différentes épreuves

Lors de la délibération, cette unité d’enseignement vaut 160 points (8 crédits*20) sur le nombre total de points du PAE de l’étudiant.

Pour réussir cette UE, il faut obtenir la note minimale de 10/20 de moyenne.

La présence à toutes les séances de laboratoire de microbiologie médicale est obligatoire. En cas d'absence non justifiée par un document officiel (ex : certificat médical, certificat de décès d'un membre de la famille, ...), la cote correspondant aux " Rapports de laboratoire de microbiologie médicale" sera multipliée par un coefficient de pénalité tenant compte du nombre d’absences injustifiées de l’élève aux séances de laboratoire de microbiologie médicale.

De plus, en cas de trop nombreuses absences correspondant à  35 % de 49,5h du laboratoire de microbiologie médicale, l’étudiant se verra attribuer une note de 0/20 à l'épreuve "Rapports de Laboratoire de microbiologie médicale". 

Pour établir la note de l'UE2LM9 (/20) :

  • La cote globale de l’UE2LM9 (/20) est la moyenne pondérée des cotes obtenues pour la partie « Microbiologie médicale » et « Laboratoire de microbiologie médicale» qui intervient pour 81,25 % (130 points) et pour la partie « AIP Stage préparatoire en microbiologie  »  qui intervient pour 18,75% (30 points).
  • Pour la partie "Microbiologie médicale" et " Laboratoire de microbiologie médicale", en juin et en septembre les épreuves sont pondérées comme suit :
    • Rapports de laboratoire de microbiologie médicale : 20%
    • Examen de microbiologie médicale : 80 %
      • L'examen de microbiologie médicale consiste en une épreuve intégrée portant sur les activités d'apprentissage "Microbiologie médicale" et "Laboratoire de biologie médicale".
  • Pour la partie "AIP Stages préparatoires en microbiologie »,
    • En janvier : Interrogation AIP stage préparatoire en microbiologie : 100%
    • En septembre : Examen AIP stage préparatoire en microbiologie : 100%

Quelles sont les informations administratives de cette UE ?